Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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