Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Q3U6N9 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Q3U6N9 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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