Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Trim71Q1PSW8 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms