Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ptchd1Q14B62 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms