Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd1Q01822 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms