Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PtprmP28828 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PtprmP28828 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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