Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PdgfraP26618 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PdgfraP26618 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PdgfraP26618 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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