Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Vpreb1P13372 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Vpreb1P13372 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Vpreb1P13372 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vpreb1P13372 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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