Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms