Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rtf1A2AQ19 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rtf1A2AQ19 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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