Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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