Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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