Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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