Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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Ccdc39Q9D5Y1 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Ccdc39Q9D5Y1 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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