Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sgo1Q9CXH7 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms