Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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