Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hdac9Q99N13 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms