Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Reep3Q99KK1 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Reep3Q99KK1 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Reep3Q99KK1 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Reep3Q99KK1 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Reep3Q99KK1 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Reep3Q99KK1 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Reep3Q99KK1 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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