Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddb2Q99J79 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddb2Q99J79 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Ddb2Q99J79 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Ddb2Q99J79 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Ddb2Q99J79 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Ddb2Q99J79 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddb2Q99J79 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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