Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Cldn16Q925N4 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Cldn16Q925N4 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Cldn16Q925N4 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Cldn16Q925N4 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Cldn16Q925N4 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn16Q925N4 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 383.7 ms