Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Usp38Q8BW70 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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Usp38Q8BW70 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Usp38Q8BW70 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Usp38Q8BW70 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Usp38Q8BW70 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Usp38Q8BW70 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp38Q8BW70 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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