Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Actn1Q7TPR4 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Actn1Q7TPR4 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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