Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NipblQ6KCD5 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms