Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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