Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ttf2Q5NC05 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ttf2Q5NC05 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ttf2Q5NC05 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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Ttf2Q5NC05 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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Ttf2Q5NC05 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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Ttf2Q5NC05 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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Ttf2Q5NC05 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ttf2Q5NC05 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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