Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trim71Q1PSW8 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
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