Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ptchd1Q14B62 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms