Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
Sh3bp2Q06649 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp2Q06649 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms