Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd1Q01822 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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