Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RxraP28700 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RxraP28700 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RxraP28700 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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