Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Nedd9O35177 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms