Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XntrpcF8VQM8 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
XntrpcF8VQM8 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms