Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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Zfp558E9Q1J0 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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Zfp558E9Q1J0 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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Zfp558E9Q1J0 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zfp558E9Q1J0 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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