Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms