Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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Hmcn1D3YXG0 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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Hmcn1D3YXG0 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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Hmcn1D3YXG0 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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Hmcn1D3YXG0 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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Hmcn1D3YXG0 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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Hmcn1D3YXG0 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Hmcn1D3YXG0 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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