Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Grik3B1AS29 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.5 ms