Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M5A7VMS3 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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