Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CtcflA2APF3 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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