Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprfA2A8L5 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PtprfA2A8L5 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PtprfA2A8L5 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprfA2A8L5 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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