Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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