Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rabgef1Q9JM13 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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