Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot9Q9JKY0 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
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