Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RabggtaQ9JHK4 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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