Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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