Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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