Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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