Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hdac9Q99N13 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms