Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Usp38Q8BW70 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Usp38Q8BW70 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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Usp38Q8BW70 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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Usp38Q8BW70 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp38Q8BW70 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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