Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg4cQ811C2 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.6 ms