Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NipblQ6KCD5 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NipblQ6KCD5 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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